毛南族有自己的語言，屬漢藏語系壯侗語族侗水語支。據(jù)專家考證，毛南語約在12世紀從侗水語支分離成為獨立的語種，并形成自己的結(jié)構(gòu)系統(tǒng)及特點。因居住較集中，毛南語內(nèi)部基本一致，沒有方言土語差別。同時，在音節(jié)結(jié)構(gòu)方面，又保留本語族一定的特征。

毛南語音結(jié)構(gòu)復(fù)雜，有聲母66個，其中腭化聲母16個，唇化聲母13個，濁塞音及鼻音聲母各兩套，舌面音聲母、腭化聲母和唇化聲母各一套。此外還有送氣的清塞音與清塞擦音聲母，以及V、W各有不同音位之特點。有韻母86個，其中元音16個，音位關(guān)系復(fù)雜，有10個處于長短對立狀態(tài)。有的則可以跟高元音與清塞音等韻尾結(jié)合成韻。但韻母Y、L受漢語的直接作用較突出。共有8個調(diào)類，包括6個舒聲調(diào)和2個促聲調(diào)，且跟漢語的平、上、去、入(各分陰陽)相當(dāng);促聲調(diào)的調(diào)值因元音的長短不一而有所不同。整個調(diào)值受桂北壯語影響較深。

實用的大量固有詞語中，同義詞和近義詞豐富;量詞作計算事物數(shù)量單位外，還可以給事物區(qū)分類別。毛南語跟本語族存在不少同源詞，尤其與水族語言接近，因此它表達的空間遼闊，具備語言趨同因素。

毛南語構(gòu)詞的手法多且有特色。如表達概念的方式有比擬、聯(lián)想和轉(zhuǎn)義等。單純詞的結(jié)構(gòu)有聲有雙聲和疊韻關(guān)系;漢語借詞為整體吸收，其音節(jié)在毛南語中大都沒有意義。

合成詞有三種九類方式，即有帶詞頭、帶詞尾及附加音節(jié)于后等類型。另有相當(dāng)數(shù)量詞語的序列與漢語相反，如稱牛肉為肉牛，稱菜園為園菜等等。在語法中的詞類(較漢語多一個語氣詞及象聲詞)、詞組、句子成分和語序跟漢語基本一致，特別是同本語族更接近，其語序亦為主語—謂語—賓語。

受漢族，壯族等兄弟民族影響，會講漢語的人增多，有些混居和散居于城鎮(zhèn)的毛南族，他們的母語音調(diào)已不純正，壯語詞匯增多，采用漢語重疊形式、部分修飾成份移在中心詞前面的現(xiàn)象普遍化了。