至元三年(1266年)，忽必烈遣兵部侍郎郎赫德、禮部侍郎殷弘出使日本。忽必烈在國書中，對這次遣使的目的講的極其清楚，要日本效法高麗，舉國來朝以通和好，如不相通好，將至“用兵”，令日本“王其圖之”。被日本以書辭無理，不能接受，予以退回。此后幾經(jīng)出使，均被日本拒絕。

從至元十年(1273)起，忽必烈開始著手部署征日戰(zhàn)爭。至元十年四月，耽羅島林衍起義，反對高麗王的統(tǒng)治，忽必烈乘機(jī)派元軍駐高麗。之后，元軍于耽羅島設(shè)招討司，駐扎鎮(zhèn)邊軍一千七百人，從而控制了日本與南宋間的海上通道，由此可以使元軍可以全力進(jìn)攻日本。隨后，忽必烈召忻都、金方慶等至元大都(今北京)商議征日事宜。至元十一年(1274)正月，忽必烈命令高麗王造艦九百艘，其中大艦可載千石或四千石者三百艘，由金方慶負(fù)責(zé)建造;拔都魯輕疾舟(快速艦)三百艘，汲水小船三百艘，由洪茶丘負(fù)責(zé)建造，并規(guī)定于正月十五日動工，限期完成。

六月，九百艘軍艦完工，上報世祖忽必烈，忽必烈遂命令由蒙、漢、高麗三族軍隊組成的聯(lián)軍，東征日本。聯(lián)軍的核心是蒙元部隊計有蒙漢軍二萬人、高麗軍五千六百人，加上高麗水手六千七百人，共三萬二千三百人，由征東都元帥忻都、右副帥洪茶丘、左副帥劉復(fù)亨統(tǒng)帥，八月出發(fā)。

當(dāng)時的蒙古軍隊經(jīng)過成吉思汗的訓(xùn)練，軍紀(jì)森嚴(yán)，每十人、百人、千人、萬人各為一個戰(zhàn)斗隊，每隊設(shè)一長率領(lǐng)，組織極為嚴(yán)密，因此英勇善戰(zhàn)，戰(zhàn)斗力很強(qiáng)。此外，元朝當(dāng)時的火器使用技術(shù)在世界上處于領(lǐng)先水平，曾經(jīng)威鎮(zhèn)歐洲，所以火炮作為此次征日作戰(zhàn)的秘密武器，出現(xiàn)在元軍的戰(zhàn)斗序列中。

而日本武士部隊的基礎(chǔ)是守、介地頭制(莊頭制)，是源賴朝建立幕府時期形成的兵制。任守、介地頭職的武士，多為有功于歷代將軍或執(zhí)權(quán)的家臣，即“御家人”。守，是掌握某一地方兵馬大權(quán)的最高行政長官，但從其品秩看，也不過是從五位上到正六位下的中下級官員;地頭，是管理公私土地進(jìn)行征稅的官吏，并對其管理的土地?fù)碛芯鞕?quán)，其職位更低，隸屬于守。他們按其管理的土地面積大小，蓄養(yǎng)私兵。某一守率隊出征，其一族的家人、族人即成為該守部隊的骨干隨同出陣，守所轄的地頭，亦率其家人、郎黨自成一隊，歸守指揮。這種主從關(guān)系構(gòu)成的部隊，組織鞏固，不易潰散，散而可以重聚。家臣以死于君主馬前為榮，因此戰(zhàn)斗力頗強(qiáng)。但是，這種隊伍又各自為戰(zhàn)，指揮不統(tǒng)一，戰(zhàn)斗時偏重于一騎對一騎的單打獨斗方式，因此戰(zhàn)斗幾乎是混亂、無組織、無紀(jì)律的，不易于指揮，無戰(zhàn)術(shù)可言，根本無法和元軍相抗衡，整體戰(zhàn)力相當(dāng)弱。

至元十一年(1274)侵日元軍在忻都、洪茶丘、劉復(fù)亨三將的指揮下，十月三日從高麗合埔(今韓國鎮(zhèn)海灣馬山浦附近)出發(fā)，駛向?qū)︸R。十月五****近對馬島。當(dāng)?shù)氐仡^宗馬允助國，召集八十余騎弛向元軍登陸據(jù)點，雙方展開激戰(zhàn)。由于眾寡懸殊，宗馬允助國及其嫡子養(yǎng)子共12人戰(zhàn)死，對馬守護(hù)軍全部被殲，六日占領(lǐng)對馬島。也有史料記載宗馬允助國是在壹歧島戰(zhàn)死。十四日傍晚，元軍攻入壹岐島。元軍二船約四百人先行登陸，部隊上陸列好隊伍后即立赤旗為標(biāo)記，與守護(hù)軍左衛(wèi)門尉平經(jīng)高(平內(nèi)左衛(wèi)門景隆)所率領(lǐng)的百余騎激戰(zhàn)。經(jīng)高軍戰(zhàn)斗不利，退于城內(nèi)防守。十五日陷城破，經(jīng)高自殺殉城。十六日，元軍逼近了肥前沿海島嶼及西北沿海一帶。

肥前是日本九州的西南沿海地區(qū)的古地名，包括了今天的長崎和佐賀兩縣。當(dāng)時日本也是實行閉關(guān)鎖國的政策，在九州的大宰府設(shè)立總督府——太宰府，負(fù)責(zé)九州的軍事防衛(wèi)和國家的外交，因此肥前地區(qū)實際上是日本對外交流的窗口，多次受到外來文化的侵蝕和軍事力量的打擊，而它的佐世葆軍港，至今還是美國太平洋艦隊的重要基地，至于長崎，相信誰也不會忘記落在它頭上的那顆原子彈帶給世人的震驚。

大宰府西守護(hù)所少貳兼任“三前二島”守護(hù)藤原經(jīng)資得到元軍進(jìn)攻對馬的戰(zhàn)報后，一邊上報幕府，一邊部署防御。而戰(zhàn)報在十月十七曰方送到鐮倉幕府，十八曰至京都。到十月二十二日，方知對馬島為元軍所占領(lǐng)，而這時，元日第一次戰(zhàn)斗已經(jīng)結(jié)束了。從這一情況來看，日本朝廷和幕府對元軍侵日戰(zhàn)爭，沒有任何具體的部署和指揮，戰(zhàn)斗主要在大宰府少貳藤原經(jīng)資的指揮下進(jìn)行的。

元軍并沒有在肥前登陸向縱深發(fā)展，而是把主力轉(zhuǎn)移向博多灣。十月十九日，元軍艦隊進(jìn)攻博多灣，殺散海濱守軍占領(lǐng)今津一帶。由于今津一帶地形不利于大部隊展開作戰(zhàn)，且距離大宰府尚有一日行程。因此元軍當(dāng)晚回到船上，準(zhǔn)備次日進(jìn)攻大宰府。

二十曰晨，元軍展開登陸戰(zhàn)，一部元軍從博多灣西部百道源濱海一帶登陸，昨晚已在此布陣的第一線指揮藤原景資所率領(lǐng)的五百騎兵，并沒有趁元軍登陸半途截?fù)?，而是在元軍登陸整頓好隊型后，方才按日本當(dāng)時會戰(zhàn)的慣例，由主攻部隊放“鳴鏑”表示進(jìn)攻開始，這種戰(zhàn)術(shù)不過是中國春秋時期宋襄公的翻版罷了。日軍由一名武士單騎溺戰(zhàn)，沖在前邊，大隊騎兵隨后沖殺。當(dāng)日本武士騎兵部隊逼近時，元軍鼓聲大作，殺聲震天，硬弓短矢，大炮轟鳴，日本武士對元軍的戰(zhàn)術(shù)，完全沒有思想準(zhǔn)備，心驚膽戰(zhàn)，戰(zhàn)馬驚恐不前;兩軍剛一接觸，日本武士軍隊便死傷嚴(yán)重，百道源戰(zhàn)場日軍“伏尸如麻”，元軍很快推進(jìn)至鹿原。

另一部元軍攻入百道源西部的赤坂，肥后武士菊池二郎武房率自己所部武士一百三十騎與元軍展開戰(zhàn)斗。大宰府少貳藤原經(jīng)資所率領(lǐng)的武士部隊，按一族一門的戰(zhàn)斗組織形式，輪番與占領(lǐng)赤坂的元軍進(jìn)行殊死戰(zhàn)斗，終于迫使這部分元軍向鹿原方向后撤?；鹋谠趹?zhàn)斗中發(fā)揮了重要作用。在元軍撤退時，肥后武士竹崎季長率自己的族人四騎，尾追元軍，負(fù)傷落馬僥幸未死。元日戰(zhàn)后，竹崎季長以自己參加戰(zhàn)斗的經(jīng)驗和目睹實況為基礎(chǔ)，繪畫《蒙古襲來繪詞》一卷，為研究元日戰(zhàn)爭留下了比較逼真的史料。在其中一幅畫的左面，畫有一個正在爆炸火光四射的球形鐵火炮，說明火炮在這次戰(zhàn)爭中的應(yīng)用?！短接洝分幸灿涊d：“擊鼓之后，兵刀相接，拋射出球形鐵炮，沿山坡而下，形如車輪，聲震如霹靂，光閃似閃電，一次可發(fā)射兩三個彈丸，曰本兵被燒害者多人，城上倉庫著火，本應(yīng)撲滅，但無暇顧及?！?/p>

鹿原及鳥飼一帶的元軍，繼續(xù)登陸，擴(kuò)大占領(lǐng)地面。日本北九州各地武士如怡土松浦黨、原田一族、日田、栗尾、山田氏等所率各隊武士，先后趕到戰(zhàn)場，一隊一隊輪番進(jìn)攻元軍。盡管武士軍隊人數(shù)不少，但就每一隊而言，都教元軍為少，因而死傷慘重。

這時，另一部分元軍從博多灣東部箱崎方向登陸，占領(lǐng)岸邊松林，從背后夾擊與百道源元軍作戰(zhàn)的日本武士。該地守軍大友賴泰的武士隊伍經(jīng)不起元軍的夾擊，開始向東南方撤退。由于大友賴泰部隊的撤退，與百道源元軍作戰(zhàn)的日軍腹背受敵，被迫向大宰府水城方向撤退。

二十日，元軍與日軍激戰(zhàn)了一整天，近傍晚時候，博多灣箱崎等地先后落入元軍之手，日軍被迫全軍撤退，但元軍緊緊咬住不放，隨著撤退的曰軍節(jié)節(jié)進(jìn)逼。元軍左副帥、作戰(zhàn)指揮劉復(fù)亨為了更好地指揮作戰(zhàn)，從高坡走下騎馬前進(jìn)。這個情況被日軍前線指揮藤原景資發(fā)覺，他立即引馬搭箭，將其射落馬下。元軍統(tǒng)帥受傷，使進(jìn)攻的勢頭略受挫折，加之天色昏暗，遂停止進(jìn)攻。這時，日軍方擺脫元軍的追擊，迅速退往大宰府水城。日軍撤退后，沒有來得及逃走的老幼婦女，被俘近一千五百余人。

夜幕降臨后，戰(zhàn)斗基本停止，受傷的左副帥劉復(fù)亨，先行上船。元軍統(tǒng)帥忻都召集其余將領(lǐng)討論明天的軍事行動。經(jīng)過一天的戰(zhàn)斗，元軍對日本武士的勇猛戰(zhàn)斗，頗有懼意，而且對一隊隊參戰(zhàn)的武士部隊難以估計其準(zhǔn)確數(shù)字，以為數(shù)倍于元軍。同時元軍雖然占領(lǐng)了灘頭陣地，但死傷不少，兵疲矢盡，并且統(tǒng)帥受傷，這些對久經(jīng)戰(zhàn)陣的元軍統(tǒng)帥忻都產(chǎn)生了影響，從而不能準(zhǔn)確地判斷出戰(zhàn)爭雙方的形勢。高麗軍將領(lǐng)金方慶比較冷靜，他看到當(dāng)時的戰(zhàn)爭形勢對元軍比較有利，只要堅持苦戰(zhàn)，便能攻克大宰府，保住陣地以待援軍。所以，他建議：“我軍雖少，但已入敵境，人自為戰(zhàn)，即孟明焚舟、淮陰背水計也?！钡橇碛写蛩愕男枚挤駴Q了金方慶的意見，他認(rèn)為：“小敵之堅，大敵之擒。策疲兵入境，非完計也，不若班師?！庇谑切枚紱Q定，全軍撤退到船上，明日班師。

如果元軍就此班師回去，到也不算失敗，頂多是打個平手，但天有不測風(fēng)云，就在忻都決定班師的前一天晚上，博多灣出現(xiàn)了罕見的臺風(fēng)暴雨。日本群島四面環(huán)海，除東北部沿海外，均被來自熱帶太平洋的暖流所環(huán)繞，也就是我們常說的黑潮，氣候形成較溫和潮濕的海洋性季風(fēng)氣候。在每年八、九、十月間，日本西部和南部常遭臺風(fēng)襲擊;博多灣恰好正位于臺風(fēng)的襲擊區(qū)內(nèi)，恰好就在元軍準(zhǔn)備回國的最后時刻，臺風(fēng)也恰好趕到了.

由于不熟悉地形，元軍停泊在博多灣口的艦隊一片混亂，不是互相碰撞而翻，就是被大浪打沉;午夜后，臺風(fēng)漸停，但暴雨又降，加上漆黑一片，落海的兵卒根本無法相救。忻都怕日軍乘機(jī)來襲，下令冒雨撤軍回國。此役，元軍死亡兵卒達(dá)1.35萬人。日本史書則稱之為“文水之役”。

第二天即二十二日早，日軍在大宰府水城列陣，但不見元軍進(jìn)攻，派出偵察人員始知博多海面已無元軍船只，元軍撤退了。日本朝野對突如其來的臺風(fēng)趕走元軍十分驚喜，在全國范圍內(nèi)展開了大規(guī)模拜神活動，稱為“神風(fēng)”。此后“神風(fēng)”一詞陪伴了日本人670多年，直到公元1945年。

元世祖忽必烈第一次派遣元軍入侵日本的目的，在于威嚇日本，使其迅速通好，尚無滅日的決心。忻都等元軍統(tǒng)帥利用忽必烈的這種想法，巧妙地掩飾了遭風(fēng)敗退的事情，以“入其國敗之”的戰(zhàn)績，上報世祖。忽必烈信以為真，認(rèn)為日軍在元軍的打擊下，受到了應(yīng)有的懲罰，必將立刻與元通好。因此，大賞征日有功將士，同時決定派出禮部侍郎杜世忠、兵部郎中何文著等，攜帶國書出使日本，以求通好。四月，元使杜世忠一行繞過大宰府，直抵長門室津(今天日本本州西南沿海山口縣)，企圖順利地闖過關(guān)卡，到達(dá)京都或鐮倉。但長門守護(hù)卻將元使杜世忠等人押送大宰府，然后上報幕府。北條時宗得到此消息后，立命將元使送至鐮倉。然而，北條時宗，既無接受國書，也不考慮其他后果，下令將元使杜世忠一行三十余人斬首于鐮倉龍口，只放逐了四名高麗船員。

五年以后，元世祖忽必烈再次部署遠(yuǎn)征日本，后仍因臺風(fēng)以失敗告終，而且損失慘重。