嘉慶元年(1796)，乾隆皇帝舉行禪位大典，把皇位傳給皇十五子嘉親王颙琰，自己則當(dāng)上了太上皇。但是，乾隆并沒(méi)有放棄權(quán)力，規(guī)定凡遇軍國(guó)大事、用人行政之大端都要親自過(guò)問(wèn)，和珅也就仍然得以專權(quán)。但形勢(shì)畢竟有了變化，和珅當(dāng)然也有所擔(dān)心，害怕嘉慶日后會(huì)處治他，于是采取了相應(yīng)的對(duì)策。

首先，他極力限制嘉慶培植、任用自己的人。嘉慶即位后，他的老師時(shí)任廣東巡撫的朱珪進(jìn)頌冊(cè)，本來(lái)很正常，和珅卻在乾隆面前告了朱珪一狀，大加指摘，乾隆未予理睬。不久，乾隆準(zhǔn)備召朱珪回京，升任大學(xué)士，和珅感到這是對(duì)自己的極大威脅。當(dāng)嘉慶寫(xiě)詩(shī)向老師表示祝賀時(shí)，和珅便迫不及待地拿著尚未寫(xiě)完的詩(shī)稿，向乾隆告嘉慶的狀，誣稱“嗣皇帝欲市恩于師傅”。

這一次，乾隆生氣了，問(wèn)身旁的軍機(jī)大臣董誥：“這在法律上屬于什么行為？”幸虧董誥跪諫：“圣主無(wú)過(guò)言”，乾隆才作罷。但是，朱珪內(nèi)召升用一事終于寢命未發(fā)，而且和珅隨即又找了個(gè)借口鼓動(dòng)乾隆把已任兩廣總督的朱珪降調(diào)為安徽巡撫。后來(lái)，朱珪先后升授兵部尚書(shū)和吏部尚書(shū)，本應(yīng)回京供職，但和珅始終不簡(jiǎn)放新任安徽巡撫，使朱珪只得繼續(xù)署任，不能交卸。同時(shí)，和珅又將其老師吳省蘭派到嘉慶身邊，名義上是幫助嘉慶整理詩(shī)稿，實(shí)則監(jiān)視嘉慶的言行。

嘉慶皇帝城府很深，他知道只要太上皇乾隆還活著，就動(dòng)不了和珅，而且和珅在很大程度上可以左右乾隆的旨意，弄不好反而于己不利，所以他韜光養(yǎng)晦，事事順從太上皇，不發(fā)表自己的見(jiàn)解，政事不做任何更張，實(shí)際上就是容忍和珅繼續(xù)專權(quán)，只把和珅的一舉一動(dòng)看在眼里，卻絲毫不動(dòng)聲色。當(dāng)有人向他說(shuō)和珅不好時(shí)，他反而批評(píng)說(shuō)，我正要依靠和珅來(lái)治理國(guó)家，你們?yōu)槭裁匆磳?duì)他呢？甚至有事要奏明乾隆，嘉慶也有意托和珅代奏，表示對(duì)和珅充分信任。經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的相互試探，嘉慶終于將和珅麻痹了。

嘉慶二年(1797)，領(lǐng)班軍機(jī)大臣阿桂病故，和珅順理成章地成了領(lǐng)班軍機(jī)大臣。這時(shí)，大學(xué)士王杰因看不慣和珅已稱病告退，董誥丁憂回了老家，和珅在軍機(jī)處說(shuō)一不二，可以任意呼風(fēng)喚雨了。加之，乾隆日益老邁，記憶力下降，“昨日之事，今日輒忘，早間所行，晚或不省”。和珅出納帝命，口銜天憲，頤指氣使，為所欲為，“封擅甚于前日，人皆側(cè)目，莫敢誰(shuí)何”。